Федор Борисович, старший сын волоцкого князя Б. Васильевича и княгини Ульяны Михайловны Холмской.
Дата и место рождения князя неизвестны; назван в честь великомученика Феодора Стратилата (умер около 319 г.). Впервые упоминается в духовной грамоте своего отца (1477 г.), где ему завещаны города Волоколамск, Ржев и Руза.
В 1497 г. Федор вместе со своим братом, рузским князем Иваном (умер в ноябре 1503 г.), через митрополита Симона (умер 26 (по другим данным, 30) апреля 1511 г.) бьет челом великому князю Ивану Васильевичу о замене московских сел, доставшихся им по наследству, на тверские, лежавшие ближе к их уделу; вследствие этого ходатайства братья-Борисовичи получают летом того же года волости Буйгород и Колпь.
В 1500 г. Федор вместе с братом Иваном принимает участие в качестве начальников великокняжеских войск в битве с литовцами близ р. Ловати (впадает в озеро Ильмень); тогда же братья берут г. Торопец.
Летом 1502 г. Федор, командуя полком «правой руки», участвует в неудачном походе князя Дмитрия Ивановича Жилки под Смоленск.
В конце 1503 г. женится на княжне Марии, неизвестной по происхождению; на его свадьбе заболевает и вскоре умирает его брат Иван. Благодаря стараниям «духовного отца» умершего, игумена Иосифа Волоцкого (умер 9 сентября 1515 г.), удел Ивана — Руза и половина Ржева переходят не к Федору, а в казну великого князя.
В конце весны 1506 г. участвует в походе московского войска нового великого князя Василия Ивановича на Казань; командует полком «правой руки».
В 1507–1509 гг. Федор конфликтует с игуменом Иосифом из-за его роли с завещанием брата. Сначала игумен Иосиф, желая умилостивить князя, «начат князя мздою утешати и посла к нему иконы Рублева писма и Дионисиева» (иконописцы Андрей Рублев, умер около 1430 г. и Дионисий, умер после 1503 г. — Д.В. Донской), а когда это не помогло, просит великого князя Василия Ивановича принять монастырь под его покровительство. Несмотря на увещевания великого князя, притеснения Федора продолжаются и тогда великий князь исполняет просьбу игумена Иосифа.
28 декабря 1512 г. в г. Можайске Федор присоединяется к войску великого князя Василия Ивановича, идущего под Смоленск. Без успеха в марте 1513 г. возвращается к себе.
Князь Федор Борисович умирает 3 мая (по другим данным, «на память святыа мученици Пелагеи» (умерла около 290 г. — Д.В. Донской)) 1513 г.; погребен в Иосифо-Волоцком монастыре (в 18 верстах к северо-востоку от Волоколамска на левом берегу Спировки), в подземной церкви-усыпальнице, рядом с братом. Удел князя был присоединен к великокняжеским землям, а бездетная вдова, княгиня Мария, была сослана в Покровский Суздальский монастырь на р. Каменке (правом притоке Нерли), пострижена под именем инокини Александры и впоследствии погребена там же в соборной церкви.